2003年，连花清瘟胶囊治疗流感的随机双盲、对比、多中间新药3期临床实验，由中国中医科学院广安门病院等四家病院合营完成。实验过程严格按照《药品注册治理办法》及GCP请求进行质量控制和规范，成果证实连花清瘟明显改良流感样症状，为其获批新药上市供给了临床证据支撑。
2009年，连花清瘟胶囊随机双盲、多中间与奥司他韦对比治疗甲型H1N1流感临床研究，由首都医科大年夜学从属佑安病院结合8家病院合营完成。成果证实连花清瘟在病毒核酸转阴时光方面与奥司他韦相当，退热时光及缓解咳嗽、咽痛、乏力等流感样症状优于奥司他韦，治疗费用仅相当于奥司他韦的1/8，显示出综合干涉优势。
2020年，连花清瘟治疗新冠肺炎前瞻性、随机、对比、多中间临床研究在武汉随即展开。因为新冠疫情刚爆发，其发病规律、预后与逝世亡尚不明白，临床实验学术委员会专家评论辩论认为，采取双盲、安慰剂对比不克不及保障病人的生命安然，是以决定采取随机、对比、多中间研究办法。由武汉大年夜学人平易近病院等全国9个省23家病院合营完成，第三方CRO公司负责监查和质量控制，第三方统计单位完成数据治理和统计分析，包管其客不雅性与科学性。研究成果证实：与惯例治疗组比拟，连花清瘟明显进步临床症状（发烧、乏力、咳嗽）的消掉率（91.5％vs.82.4％）、CT好转率（83.8％vs.64.1％）和临床治愈率（78.9％vs.66.2％），降低转重型率50%显示出优胜趋势，该研究成果揭橥于国际有名植物医学期刊Phytomedicine。
2021年，连花清瘟对新冠肺炎密切接触者1976例前瞻性、开放标签、对比实验，由河北医科大年夜学从属第二病院主持完成。成果显示密接人群预防应用连花清瘟后核酸检测阳性率较对比组降低76%，为新冠肺炎密切接触者供给了预防用药选择，研究成果揭橥于Evidence-Based Complementary and Alternative Medicine。
随机双盲多中间、随机对比多中间、真实世界研究等都是国际医学界承认的药物临床评价办法，针对不合病种、不合情况、不合阶段，可以采取个中任何一种研究办法，成果都是具有科学价值的，中药连花清瘟从研发上市至今已有18年，是国内开展临床评价研究十分多的立异中药。
相对于现代标准的临床研究，两千年中医药在疫病防控中的用药经验更为宝贵。连花清瘟汲取中医药两千年抗疫三朝名方化裁而成，以东汉张仲景《伤寒杂病论》麻杏石甘汤与清代吴鞠通《温病条辨》银翘散为基本方，汲取明代吴又可《温疫论》治疫病用大年夜黄经验，并参加芳喷鼻化湿护脾胃的藿喷鼻，进步免疫护正气的红景天，表现了“先证用药、截断病势，整合调节、多靶干涉”的防治结合的独特优势。
实验研究也证实了连花清瘟具有效克制SARS病毒、甲型H1N1、H3N2流感病毒、新冠肺炎病毒（野生型、德尔塔、奥密克戎病毒株），同时有效抗菌、退热、止咳化痰、调节免疫功能，在我国甲流和新冠肺炎疫情防控中发挥了重要感化。“连花清瘟治疗风行感冒研究”获得2011年国度科技进步二等奖，“连花清瘟治疗新冠肺炎研究”获2020年河北省科技进步一等奖。同时连花清瘟被列入“三方三药”30次被国度卫健委、国度中医药治理局以及各省推荐用于疫情防控，列入国度卫健委《新型冠状病毒肺炎诊疗筹划（试行第九版）》。
